Desde sus inicios el museo se ha mostrado como un espacio abierto al profesorado, y la organización de cursos de formación es una constate desde hace más de una década.

Los Seres Vivos en el Aula Escolar, Más de un kilo dentro del cráneo, Experiencias sencillas con la célula, La ciencia de la espeleología,… son algunos títulos de la variedad de cursos ofertados años tras año y dirigidos al profesorado, tanto de Primaria, de Secundaria, como de Bachillerato.